Opplevelsen av å være i praksis hos Norsk Polarinstitutt

Skrevet av André Johansen Marhaug, bachelorstudent ved Institutt for arktisk og marin biologi.

Nå er jeg ferdig med min praksis i seksjonen for miljørådgivning (SMIR) hos Norsk Polarinstitutt og jeg har hatt det veldig fint hos dem. Kollegaene på seksjonen har vært hyggelig og tatt meg godt imot fra første dag. Jeg har virkelig følt meg som en del av gjengen i SMIR.

Personlig har jeg lært veldig mye med å være i praksis hos Norsk Polarinstitutt. Jeg har fått et innblikk i hvordan det er å jobbe i en stor institusjon og jeg har observert og deltatt på mange av prosessene som skjer innad i institusjonen. Jeg har også lært spesielt mye om hvordan Norsk Polarinstitutt er bygget opp og hvordan de jobber med forskning, miljøforvaltning og rådgivning i de polare områdene.

Jeg sitter igjen med masse kunnskap om dyrelivet og miljøet i de polare områdene. Jeg har lært spesielt mye om hvordan dyrelivet blir påvirket av forstyrrelser fra oss mennesker, og konsekvensene hvis vi ikke tar hensyn til dette. Jeg har også fått en god innsikt i noen programmer som overvåker miljøet i de polare områdene, som f.eks. miljøovervåkning Svalbard og Jan Mayen (MOSJ).

Gjennom arbeidet med f.eks. MOSJ og kartleggingen av menneskelig forstyrrelser på dyreliv i Arktis og Antarktis har jeg forstått viktigheten i forvaltning av dyrelivet og miljøet. Dyrelivet i de polare områdene er svært sårbare og konsekvensene av for stor grad av forstyrrelse fra oss mennesker kan være ganske store. Det syns jeg det er for lite fokus på.

For oss biologer har jeg merket at det er mye fokus på forskning mens forvaltningen og rådgiving kan bli satt litt i skyggen. Poenget med forvaltning og rådgivingen er jo å bruke forskningen så forskningen blir formidlet og brukt. For eksempel vil forskning gjort på Svalbardsrype kunne brukes til forvaltningen av populasjonen. Vi trenger forskning for å kunne forvalte dyreliv og miljø på en god måte og for å finne gode svar på miljøspørsmål.

Dette er noe jeg har fått et litt nytt syn på etter praksisen min i SMIR. Jeg ser viktigheten med forvaltning og rådgivning og at det blir feil å bare forske på noe fordi det er spennende. Jeg mener at vi bør ta forskningen i den retningen så vi forsker for å bruke det til noe. For eksempel å redusere menneskelig forstyrrelser på dyrelivet på Svalbard.

Etter praksisen min hos SMIR har jeg fått en større interesse for både dyrelivet og miljøproblemene i de polare områdene. Dette er noe jeg vil utforske mer og jeg har søkt på masterretningen Arctic Marine Ecotoxicology hos UIT. Jeg godt tenke meg å søke jobb hos Norsk Polarinstitutt etter jeg er ferdig å studere. Jeg syns det de jobber med er svært viktig og spennende og noe jeg kunne tenkt meg å jobbe med i framtiden. De på seksjonen har også vært gira på at jeg skal skrive masteroppgave hos Norsk Polarinstitutt, noe jeg også håper jeg får til.

Jeg har hatt et fint praksisopphold hos SMIR og det har inspirert meg til å jobbe med de polare områdene og miljøproblemene i Arktis i framtiden. Jeg har lært mye, både personlig og faglig. Og jeg tror det praksisen hos Norsk Polarinstitutt kommer til å hjelpe meg i framtiden med tanke på jobbmuligheter.

Takk for meg, NIBIO

Skrevet av Sigrid Vold Jensen, masterstudent ved Institutt for arktisk og marin biologi.

Da nærmer det seg slutten av mitt praksisopphold hos NIBIO. For en fin tid det har vært. Derfor er det også litt vemodig at det er over for denne gang.

Gjennom min tid hos NIBIO har jeg erfart hvor variert arbeidsdagen til en biolog kan være. Jeg har opplevd å være ute på en skjærgård i vind og vær den ene dagen. For så å sitte inne på et varmt kontor å lese korrektur på rapporter den andre dagen. Kontraster kan jeg like.

Jeg har bidratt på tre av NIBIO sine pågående prosjekter. De dreier seg om forskning på utfordringer i reindriften, grågås-problematikken i landbruket, og innvirkninger av isskader på gressletter. Gjennom arbeid på disse prosjektene har jeg erfart en hel del. Blant annet hvordan man håndterer reinsdyr under merking med GPS-sendere, hvordan prosessen for å analysere videomateriale av dyr kan foregå, samt hvordan man preparerer grasprøver på laboratorium. Det har vært lærerikt og engasjerende å jobbe med såpass ulike oppgaver, sammen med dyktige fagfolk.

Bilde fra Ljøssøya. Foto: Sigrid Vold Jensen.

Særlig syntes jeg det var interessant å få ta del i videoanalyse av drøvtyggingsmønsteret til reinsdyr. Her fikk jeg prøve meg frem med egne metoder. Jeg fikk jeg selv bestemme klassifisering av reinsdyrenes adferd i videoene, organisere dataene, og leke meg med statistiske modeller i programmet R. Det var vanskelig, men gøy. Ikke minst var det god øving til min egen masteroppgave. Dataene fra mitt arbeid kan muligens bli inkludert i en fremtidig artikkel også. Det hadde vært utrolig spennende!

Alt i alt er jeg veldig fornøyd med praksisperioden min hos NIBIO. Jeg sitter igjen med mye ny kunnskap og praktiske erfaringer som vil komme til nytte både i videre utdanning og i framtidig jobb. Praksisen har reklamert godt for biolog som yrkesretning, og har gitt meg ny drive til å ta fatt på masterprosjektet mitt.

Jeg er veldig takknemlig for å ha fått samarbeide med den flinke arbeidsstaben på Holdt, og at jeg har fått blomstre i arbeidsoppgaver både i samarbeid og selvstendig. En særlig takk må jeg rette til min engasjerte veileder Jo Aarseth! Takk for nå NIBIO. Kanskje vi sees igjen?

Praksisen er en del av kurset BIO-2014 Praksis i næringslivet for biologistudenter.

Lese fiskealder på øresteiner, telling av fisk med video og overlevelse av fiskeegg i Skjomen

Skrevet av Tristan Kalvenes Natvig, bachelorstudent ved Institutt for arktisk og marin biologi.

Foto: Sandnes1970/mostphotos.com

I min praksis hos NINA har jeg fått jobbe med flere forskjellige prosjekter. Det var mange tilgjengelige oppgaver, men med tidsrammene til praksisfaget ble jeg tildelt tre oppgaver. Jeg har jobbet med øresteiner fra Tana-ørret, video av fisk fra Anarjokha og felttur til Skjomen. En fin miks av lab-, kontor- og feltarbeid.

Tanaelva er grenseelven mellom Norge og Finland. Den starter der hvor Karasjokha og Anarjokha møtes. Tanaelva strekker seg 361km og er Norges nest lengste elv. Tanaelva har før huset verdens største bestand av atlanterhavslaks, men det er betydelig nedgang i bestanden nå. Elva har i lang tid vært svært viktig for lokalbefolkningen og for villaksen. Det er derfor viktig å ta vare på laksebestanden her før det går for langt.

Tanaelva renner igjennom flere kommuner på norsk og finsk side. Å fiske etter laks i Tanaelva er svært ettertraktet. At fisket foregår i mange kommuner i to land gjør forvaltningen vanskelig. Vi er avhengig av gode fangstrapporteringer og enighet om reguleringer og uttak fra alle kommuner for å forvalte elva godt. Hva som gjør at laksebestanden gått ned  er fortsatt usikkert. Men at laksen er presset av flere grunner er sikkert.

En viktig del av kulturen rundt Tanaelva er laksefiske i elva og i garnfiske i havet. Det er også mange sportsfiskere som fisker her. Overfiske kan være en stor grunn til at det blir færre laks. Det diskuteres også om gjedde og ørret spiser yngelen og smolten. At det kan forverre situasjonen for en nedfisket bestand er det ingen tvil om.

Øresteiner forteller oss alderen til ørreten i Tanaelva

NINA Tromsø har flere prosjekter på laksebestanden i Tanaelva. Jeg har jobbet med øresteiner fra ørret i elva. Øresteiner (eller otolitter) er små «steiner» i hulrom på hver side av fiskens hode. De fungerer sånn som vårt balanseorgan i øret og forteller fisken hva som er opp og ned i vannet. Otolittene vokser mens fisken vokser. Det gjør at vi kan lese av fiskens alder på øresteinene. Temperatur og lys gjør at fisken vokser mer i sommerhalvåret enn vinterhalvåret. Da får øresteinene smale vintersoner og bredere sommersoner. Da kan vi se under en lupe og telle antall vinterringer. Det blir som årringer på et tre.

I tillegg til å finne alderen til ørreten registrerte jeg data om fisken, som vekt, lengde, fangstplass og fangstdato. Jeg skulle også notere ned hvor sikker jeg var på alderen jeg leste fra øresteinene. I starten jobbet jeg sakte fordi jeg var usikker. Etter flere spørrerunder med veilederen min ble jeg sikker på at dette var noe jeg hadde kontroll på. Ved prosjektets slutt fikk jeg gjort mer på kortere tid fordi jeg hadde fått erfaring.

Ekkolodd og video for å telle arter i Anarjokha

En annen jobb jeg gjorde om Tanavassdraget var å jobbe med videoer fra en av de to elvene som danner Tanaelva; Anarjokha. Her har det blitt satt opp en sonar ved elvebredden som bruker ekkolokasjon for å registrere fisk som svømmer forbi. Fiskens bevegelser og størrelse kan si noe om hvilken art det er, men antagelser basert på bare det kan også være feil. For å sjekke hvor nøyaktig vi kan anslå art og størrelse fra ekkoloddet er det satt opp kameraer på tvers av elva der sensoren er. Da kan vi sammenligne signalene fra ekkoloddet med filmen og se hvor rett vi har. Og i tillegg bli bedre på å tolke signalene vi får.

Felttur i Skjoma for å se hvor mange fiskeegg som overlever vinteren

Mitt siste prosjekt under praksisen var en felttur til Skjoma, en elv i Narvik. Skjoma ble kraftregulert for 50 år siden og har lav vannstand på vinterstid. Man tror at den lave vannstanden gjør at en del egg fra ørret og laks blir tørrlagt og dør i løpet av vinteren. Da blir det mindre ørret og laks. Hvor mange egg som dør varierer fra år til år og påvirkes mest av vannstanden på høsten. Lavt vann på høsten får fisken til å gyte på plasser som også har vann på vinteren, det kan være positivt for gytingen. Vi kartla gytegroper og anslo hvor mange egg fra høstens gyting som hadde dødt. Vi fant gytegroper i ulike deler av elva og gravde til vi fant egg. Fant vi levende egg stoppet vi å grave og anslo at alle eggene overlevde. Fant vi døde egg gravde vi til vi eventuelt fant levende egg og laget et anslag på andel av eggene som var døde. Vi lagret GPS-posisjon av gytegropen og tok prøver av eggene for DNA-testing for å finne ut hvilken fiskeart eggene er. Vi fant også flere groper med pukkellaksyngel som hadde klekket og nærmet seg turen ut i havet. De tok vi også prøver av.

Hva har jeg lært fra praksisen?

Mye av det jeg har gjort kan knyttes til ting jeg har gjort i studiene. Det har vært spennende å få bruke kunnskapene fra studiene i praksis. Jeg har fått jobbe med temaer jeg har vært interessert i hele livet og det har vært kjekt å ta del i forskningen som jeg ellers bare hadde lest resultatene fra. Jeg lærte raskt at jeg må stole på egne kunnskaper når man må jobbe selvstendig. Jeg har også lært at man i biologiens verden ofte må finne seg i at man ikke alltid kan få undersøkt alt man håpet på. Som når otolittene er umulig å lese, når mørket og uklart vann gjør kameraer nytteløse eller når været ikke spiller på lag under felttur. Småting vil alltid oppstå, men man finner som regel en løsning.

Working with antibiotic resistance and microplastics at NORCE at my internship

Written by Eirill Spadoni, bachelor student at department of arctic and marine biology.

Microplastic pollution has become a serious issue in the last decades, impacting the health of entire ecosystems as well as our own. The roughened surface of down-graded plastic particles released into the waters makes them potential growth sites for bacteria to reproduce and easily transfer genetic material to each other, facilitating the emergence and spread of antibiotic resistant strains.

Antibiotics are limited and old ones are gradually meeting more and more resistant strains due to the careless use and disposal of antibiotics. As a result, as we go forward, we may find ourselves unable to cure even the most common bacterial infections.

The project I have been assigned consists of studying the effect of different types of microplastic on the antibiotic resistance of a common bacterium.

Me at the NORCE lab in Tromsø. Photo: private.

My task is to transform and grow bacteria with particles of nylon, a plastic polymer unfortunately very commonly found in our environment, and observe how its presence affects the antibiotic resistance of the bacterium Acinetobacter baylyi. These past weeks I was taught techniques to carry out the experiments. To get some practice before starting the actual experiments, we ran some control experiments without using microplastics. We started from basic things, like the preparation of LB (Lysogeny Broth) medium, a nutrient solution in which bacteria can multiply, and agar plates, gelatinous disks essential for the in-lab growth of bacterial colonies. Although these are very simple (and essential) procedures, they were new to me: during laboratory sessions at the university, all material had been previously prepared for us. As some of the plates contained antibiotics to allow only the bacteria with the resistance gene to grow, we were taught how to properly handle and dispose of them, along with other biohazardous waste, and about the importance of risk assessments.

We learned how to maintain a sterile environment by using laminar hoods, gas burner and the autoclave. Photo: private.

At the same time, we learned of more complex procedures, such as DNA extraction, where bacteria are treated with different chemicals to dissolve their membrane and remove everything other than the DNA containing the antibiotic resistance gene to be transferred to the other strain of bacteria.

The next step of the experiment was to grow overnight cultures of bacteria. I learned that bacteria can survive temperatures of -80C degrees (!), as they are stored for further use. In this case, we took frozen bacteria left from a previous run of the same experiments and suspended them in LB medium to allow them to grow. These were successively mixed with the extracted DNA to induce them to take up the antibiotic resistance genes in a process called transformation. I was familiar with the technique, as I had done it before in a molecular biology lab, but it was interesting to use the protocol provided along the material kit.

Once the bacteria had taken the resistance genes, we made different diluted solutions. This was also something I was familiar with from some microbiology labs I had had in year 2 of the bachelor program. But repeating it and doing it independently made me gain more confidence in the procedure.

After some days we counted the colonies. The colony counting was done using a different technique that the one I was used to. Where they were too many, only a portion was counted. The colonies were big enough to be counted without using a microscope and I used instead a clicker I had never seen before.

Lately I’ve also had the opportunity to observe and help with another related project that aims to observe the difference in antibiotic resistance related to the presence of microplastics in compost and manure from Italy and Norway. The two countries have different regulations related to the use of antibiotics in farming and plastic disposal, as well as (probably) different bacteria strains and different climate. This allows us to study whether the temperature also plays a role in the antibiotic resistance spread. The samples for the experiments in Tromsø are taken from Holt and a local farm. Both compost and manure are combined with microplastics and antibiotics to be analyzed and the presence of different bacteria measured and compared to the data coming from Italy.

My tasks in this project were pretty basic: transferring samples to testing tubes and rinsing them to make them ready to be analyzed, but I enjoyed learning about this different project. I found particularly interesting how institutions from different parts of the world can cooperate on one project for a common important goal!

This internship at NORCE is part of the UiT course BIO-2014 Praksis i næringslivet for biologistudenter.