![\"Tegneserie-representasjon](\"https:\/\/blogg.uit.no\/blu002\/wp-content\/uploads\/sites\/127\/2015\/11\/PKAB3-47a-PKI.png\")
<\/a>Tegneserie-representasjon av protein kinase A (PKA), en av de best studerte protein kinasene i kroppen v\u00e5r.<\/p><\/div>\n
Overf\u00f8ringen av fosfat-grupper er en av m\u00e5ten signaler formidles i kroppen v\u00e5r.
\nI en stor organisme som et menneske er det utrolig viktig at cellene kan kommunisere med hverandre, og at de ulike komponentene i cellen er samkj\u00f8rt. Da er det ikke rart at defekter i protein kinaser er koblet til en lang rekke sykdommer, n\u00e5r plutselig cellen oversv\u00f8mmes av signaler eller ikke f\u00e5r noen tilbakemelding.
\nProtein kinaser er implisert i sykdommer fra kreft [1] til h\u00e5rl\u00f8shet[2], og er derfor et sv\u00e6rt viktig m\u00e5l for utvikling av nye legemidler.
\nEt stort problem er at de 500 protein kinasene vi har er sv\u00e6rt like, spesielt der de binder ATP. Allikevel er det nettopp ATP-bindingssetet som har vist seg \u00e5 v\u00e6re enklest \u00e5 designe legemidler for[3].<\/p>\n
I l\u00f8pet av min mastergrad[4] var jeg s\u00e5 heldig at jeg fikk samarbeide med en sveitsisk gruppe fra ETH som hadde syntetisert en rekke nye forbindelser som de forventet at ville hindre\u00a0en protein kinase som vi kaller PKA fra \u00e5 overf\u00f8re flere signaler.<\/p>\n
PKA er en av de kinasene som p\u00e5virkes n\u00e5r du drikker kaffe[5], men den er ogs\u00e5 implisert i flere kreft-sykdommer. Vi kunne demonstrere at de nye inhibitorene den sveitsiske gruppen hadde syntetisert hadde aktivitet i mot blant annet PKA.<\/p>\n
<\/a>Elektrontetthets-diagram for en av de nye inhibitorene vi utviklet<\/p><\/div>\n
Mitt st\u00f8rste bidrag til arbeidet var \u00e5 vise hvordan to av inhibitorene interagerte med en mutert versjon av protein kinasen PKA. Det gjorde vi igjennom en prosess som heter krystallografi.<\/p>\n
Krystaller som nesten ser ut som diamanter dyrkes frem av proteinet, men ingen dame blir imponert av en diamant p\u00e5 denne st\u00f8rrelsen, for de st\u00f8rste krystallene blir sjeldent mer enn en millimeter lange.<\/p>\n
Hvis man klarer \u00e5 f\u00e5 krystaller (og det er et stort hvis!) s\u00e5 kan man sende r\u00f8ngten-str\u00e5ling igjennom et krystall, og atomene som st\u00e5r i et regelmessig gitter\u00a0diffrakterer r\u00f8ngten-str\u00e5len slik at det dannes et diffraksjons-m\u00f8nsteret. Igjennom en serie med fourier-transformasjoner og utregninger kan man fra diffraksjons-m\u00f8nsteret f\u00e5 en modell over hvordan atomene er posisjonert i proteinet.<\/p>\n
P\u00e5 denne m\u00e5ten kan man se n\u00f8yaktig hvilke interaksjoner en inhibitor har med et protein, og designe inhibitorene slik at de f\u00e5r mest mulig optimale interaksjoner.<\/p>\n
<\/p>\n
[1] Lauber, B. S., Hardegger, L. A., Asraful, A. K., Lund, B. A., Dumele, O., Harder, M., Kuhn, B., Engh, R. A. and Diederich, F. (2015), Addressing the Glycine-Rich Loop of Protein Kinases by a Multi-Facetted Interaction Network: Inhibition of PKA and a PKB Mimic. Chem. Eur. J.. doi:10.1002\/chem.201503552<\/a> [5]\u00a0http:\/\/udel.edu\/~danikoll\/metabolism.html<\/a><\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":" Protein kinaser utgj\u00f8r 2% av antall proteiner i kroppen v\u00e5r. Protein kinaser overf\u00f8rer fosfat-grupper fra adenosin trifosfat (ATP) til andre proteiner, vanligvis p\u00e5 aminosyrene serin, treonin eller tyrosin som alle har en hydroksyl-gruppe. Overf\u00f8ringen av fosfat-grupper er en av m\u00e5ten signaler formidles i kroppen v\u00e5r. I en stor organisme som et menneske er det utrolig […]<\/p>\n","protected":false},"author":188,"featured_media":0,"comment_status":"open","ping_status":"closed","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"_et_pb_use_builder":"","_et_pb_old_content":"","_et_gb_content_width":"","footnotes":""},"categories":[33],"tags":[28,30,31,32,29],"class_list":["post-63","post","type-post","status-publish","format-standard","hentry","category-forskning","tag-forskning","tag-inhibitor","tag-krystallstruktur","tag-legemiddel","tag-protein-kinase"],"featured_image_src":"","featured_image_src_square":false,"author_info":{"display_name":"Bjarte Aarmo Lund","author_link":"https:\/\/blogg.uit.no\/blu002\/author\/bjarte-aarmo-lund\/"},"rbea_author_info":{"display_name":"Bjarte Aarmo Lund","author_link":"https:\/\/blogg.uit.no\/blu002\/author\/bjarte-aarmo-lund\/"},"rbea_excerpt_info":"Protein kinaser utgj\u00f8r 2% av antall proteiner i kroppen v\u00e5r. Protein kinaser overf\u00f8rer fosfat-grupper fra adenosin trifosfat (ATP) til andre proteiner, vanligvis p\u00e5 aminosyrene serin, treonin eller tyrosin som alle har en hydroksyl-gruppe. Overf\u00f8ringen av fosfat-grupper er en av m\u00e5ten signaler formidles i kroppen v\u00e5r. I en stor organisme som et menneske er det utrolig […]","category_list":"Forskning<\/a>","comments_num":"0 comments","_links":{"self":[{"href":"https:\/\/blogg.uit.no\/blu002\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/63","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/blogg.uit.no\/blu002\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/blogg.uit.no\/blu002\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/blogg.uit.no\/blu002\/wp-json\/wp\/v2\/users\/188"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/blogg.uit.no\/blu002\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=63"}],"version-history":[{"count":4,"href":"https:\/\/blogg.uit.no\/blu002\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/63\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":69,"href":"https:\/\/blogg.uit.no\/blu002\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/63\/revisions\/69"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/blogg.uit.no\/blu002\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=63"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/blogg.uit.no\/blu002\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=63"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/blogg.uit.no\/blu002\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=63"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}
\n[2] http:\/\/newsroom.cumc.columbia.edu\/blog\/2015\/10\/23\/blocking-enzymes-in-hair-follicles-promotes-hair-growth\/<\/a>
\n[3] \u00c5berg, E., Lund, B. A., Pflug, A., Gani, O. a. B. S. M., Rothweiler, U., de Oliveira, T. M., & Engh, R. a. (2012). Structural origins of AGC protein kinase inhibitor selectivities: PKA as a drug discovery tool. Biological Chemistry, 393(10), 1121\u20131129. doi:10.1515\/hsz-2012-0248<\/a>
\n[4]\u00a0Biotech applications of protein kinase affinity interactions – Bjarte Aarmo Lund May 2013 http:\/\/hdl.handle.net\/10037\/8289<\/a><\/p>\n