Elektrontetthet er teknisk sett det vi bestemmer når vi løser krystallstrukturer. Atomer med mange elektroner vises godt, hydrogener vises nesten ikke overhodet. I helga løste jeg strukturen av SMYD3 under flere betingelser. Vi prøvde å få inn ligander i allosterisk sete. Dessverre var det eneste jeg kunne se en aktivt sete inhibitor som jeg hadde […]
Covid-19 gjør mange ting spesielt. For å få best mulige data for bestemmelse av strukturen til de proteinene vi jobber med bruker vi synkrotronstråling når vi kan siden den er mer fokusert og kraftigere. Denne helga var vi så heldige at vi hadde stråletid ved European Synchrotron Radiation Facility ( ESRF ) i Grenoble, Frankrike. […]
Forrige uke satt jeg opp krystalliseringsforsøk med den epigenetiske regulatoren SMYD3. Gleden var stor da jeg så i mikroskopet i morrest og fant krystaller! Gruppen til Professor Helena Danielson har studert SMYD3 en stund,[1] og jeg reproduserte bare kjente betingelser, men det er fortsatt fint å se at man har det i fingrene. Jeg skal […]
Protein kinaser utgjør 2% av antall proteiner i kroppen vår. Protein kinaser overfører fosfat-grupper fra adenosin trifosfat (ATP) til andre proteiner, vanligvis på aminosyrene serin, treonin eller tyrosin som alle har en hydroksyl-gruppe. Overføringen av fosfat-grupper er en av måten signaler formidles i kroppen vår. I en stor organisme som et menneske er det utrolig […]