Tag Archives: enzym

Første simulering ferdig

Simuleringer er egentlig hovedfokuset mitt for oppholdet her i Uppsala, men det har vært lettere å skrive om de tingene jeg har gjort på laboratoriet til nå. Men endelig har jeg resultater å vise til også fra beregningene jeg gjør. Jeg er interessert i å studere hvordan enzymer (cellenes maskiner) får reaksjoner til å skje, […]

Et dilemma

Elektrontetthet er teknisk sett det vi bestemmer når vi løser krystallstrukturer. Atomer med mange elektroner vises godt, hydrogener vises nesten ikke overhodet. I helga løste jeg strukturen av SMYD3 under flere betingelser. Vi prøvde å få inn ligander i allosterisk sete. Dessverre var det eneste jeg kunne se en aktivt sete inhibitor som jeg hadde […]

Datasamling i Frankrike fra Sverige med prosessering i Norge

Covid-19 gjør mange ting spesielt. For å få best mulige data for bestemmelse av strukturen til de proteinene vi jobber med bruker vi synkrotronstråling når vi kan siden den er mer fokusert og kraftigere. Denne helga var vi så heldige at vi hadde stråletid ved European Synchrotron Radiation Facility ( ESRF ) i Grenoble, Frankrike. […]

På plass i Uppsala

Endelig var jeg på plass i Uppsala. Første dag gikk nesten i helhet med på møter: administrasjonen, vertskap, kollegaer og mulige samarbeidspartnere. Jeg har fått meg (gjeste)nøkkelkort og konto på den lokale superdatamaskinen, så nå er jeg klar til innsats. Jeg skal få forske på hvordan enzymers konformasjoner (form) kan endres, særskilt når partnere (andre […]

Møre poteter med kiwi?

En kollega fortalte meg at hun hadde hørt på radio at et enzym i potet ble aktivert hvis man ikke varmet opp potetene fort nok, og at man da aldri fikk potetene myke igjen. Det hørtes akkurat så sprøtt ut at jeg måtte finne ut hva det var som foregikk. Litt googling viste at det […]