Structural origins of AGC protein kinase inhibitor selectivities: PKA as a drug discovery tool

Mastergraden min handlet om protein kinaser, et av cellens kommunikasjonsverktøy.
Protein kinaser er enzymer som kjemisk modifiserer andre enzymer ved å sette fosfat-grupper (PO4) på spesifikke serin,treonin eller tyrosin-seter.
Vi kaller de protein kinaser fordi de modifiserer andre proteiner, i motsetning til andre kinaser som kan modifisere karbohydrater og lignende.

En av figurene fra artiklene der vi illustrerer den iboende fleksibiliteten i PKA fra krystallstrukturer

Jeg bidro til et minireview, “Structural origins of AGC protein kinase inhibitor selectivities: PKA as a drug discovery tool”, der vi tok for oss en av strategiene vi bruker for å studere protein kinaser. En protein kinase, protein kinase A (PKA), er etablert som en modell-kinase og fungerer godt på laboratoriet. Når lignende kinaser skal studeres kan det være enklere å modifisere PKA slik at den ligner på de andre kinasene enn å få etablert den aktuelle kinasen på laboratoriet. I artikkelen diskuterer vi hvordan denne strategien er brukt for både Aurora protein kinase og protein kinase B (PKB).

Protein kinaser er et spennende forskningsfelt, spesielt med relevansen for kreftforskning. Det viser seg nemlig at dysregulering av signallering ofte er involvert i kreftsykdommer, og det finnes flere kreftsykdommer som tilsynelatende er styrt av defekte/overregulerte protein kinaser slik som BCR-ABL og kronisk myelogen leukemi


Smaken av DMSO

Å jobbe med hansker er noe herk, og hvis det det er en HMS-synd jeg må innrømme, så er nok det at jeg står over hansker fra tid til annen. Men når jeg jobber med DMSO så bruker jeg å tenke meg om to ganger . Dimetylsulfoksid er det fulle navnet til DMSO, det er […]


Nesefett

Professor (nå emeritus) Lars Kristian Hansen hadde en laboratorieøvelse som inngikk i et kurs jeg tok i løpet av bachelorgraden min. Vi skulle løse krystallstrukturen av et lite organisk molekyl. Da hadde jeg allerede noen års erfaring med krystallstrukturer av enzymer, så jeg forventet lite utfordring. Skepsisen var derfor stor da Prof. Hansen ba meg […]


På TV igjen

UiT Norges Arktiske universitet har vært min arbeidsgiver i en årrekke. Så når jeg ble spurt om å være med i en reklamefilm for kjemi-studiet var det klart at jeg ville være med. På youtube-videoen under forteller jeg om min motivasjon for å begynne på PhD-en og hvorfor alle burde komme til Tromsø. Jeg kommer […]


Hår

Hår er forbeholdt oss pattedyrene, og vokser over hele kroppen vår(med unntak av på fotsålene og på handflatene). Mye sosial status er knyttet til hår og mengden sjampo-reklame på TV viser jo at markedet åpenbart er stort. Hår består for det meste av proteiner. Proteiner er cellens byggesteiner, og de har mange ulike funksjoner. Proteinene […]


Frisk grønn brokkoli

 Brokolli, som andre grønnsaker får sin grønnfarge fra molekylet klorofyll. Klorofyll er et pigment som vi finner hos planter, alger og cyanobakterier. Klorofyll er et ringformet molekyl, som inneholder et magnesium-ion. Hvis pH blir for lav vil det porfyrinets egenskaper endre seg, slik at magnesium-ionet ikke lengre binder og som resultat mister brokkolien mye av […]


Vær varsom med lakrisen

Glycyrrhizin er et glykosid, det vil si et organisk stoff som består av et karbohydrat(glykonet) koblet til et ikke-karbohydrat(aglykonet), som smaker minst 30 ganger søtere enn vanlig sukker. Navnet, som jeg måtte dobbeltsjekke at faktisk var korrekt norsk skrivemåte, kommer fra det latinske navnet på lakrisroten (Glycyrrhiza glabra), og glycyrrhizin er det som gir lakrisen […]


Mest sannsynlig ikke kreftfremkallende

Daglig leser vi artikler om at nye stoffer er funnet å være (potensielt) kreftfremkallende, og vel så ofte kan vi lese at de samme stoffene motvirker kreft. Det refereres da ofte til IARC sine lister over potensielt kreftfremkallende stoffer, og jeg skal ikke si noe vondt om arbeidet International Agency for Research on Cancer (IARC, […]


Reingalskap – prionsykdom blant reinsdyr

Kugalskap var i min barndom en stor trussel, og for å få bukt med sykdommen som skyldes misfoldede proteiner ble det slaktet over fire millioner kyr. Nå er en lignende infeksjon påvist hos villrein i Norge. I midten av mars fant Norsk institutt for naturforskning (NINA) en syk rein (ved hjelp av GPS-sporing), som senere […]


Gull, røkelse og myrra

I Matteus 2,11 står det skrevet De gikk inn i huset og fikk se barnet hos moren, Maria, og de falt på kne og hyllet ham. Så åpnet de skrinene sine og bar fram gaver til barnet: gull, røkelse og myrra. Bibelen sier ikke så mye om vismennene annet enn at de kom fra Østen. […]